清华大学教育学科历史悠远。1926年，清华大学建立教育心理学系。1979年，清华大学教育研究室成立。1985年更名为清华大学教育研究所。2009年，清华大学教育研究院正式成立。历史上，一大批教育界著名学者如，朱君毅、邱椿、汪懋祖、吴俊生、孟宪承、田培林、罗廷光、陈友松等在此弘文励教，培养英才。
改革开放以来，清华大学教育研究院在学科建设、人才培养、科学研究、社会服务和国际交流与合作等方面取得了突出成就，为国家培养了大批优秀人才。在工程教育、高等教育、教育政策管理以及教育技术方面具有鲜明特色和优势。以谢维和、史静寰、王孙禺、石中英、刘惠琴、袁本涛、林健、程建钢、李曼丽、叶富贵、HamishCoates等为代表的师资队伍实力雄厚、学术视野开阔、研究经验丰富、国际化水平高。
截至目前，教育研究院已为高校、国家机关、教育管理部门、重点企事业单位以及优质中小学校培养输送了高质量的毕业生700余人。